Σε ήρεμη ψυχική κατάσταση και με δόλο ενήργησαν, σύμφωνα με το σκεπτικό της απόφασης του ανακριτή, οι δύο ψαράδες που κατηγορούνται για τον θάνατο του Σήφη Βαλυράκη, οι οποίοι, από την περασμένη Παρασκευή, έχουν προφυλακιστεί.
Σύμφωνα με την απόφαση του ανακριτή για την προσωρινή τους κράτηση, «ενεργώντας με πρόθεση από κοινού, έχοντας κοινό δόλο και μετά από συναπόφαση και συνεννόηση με συγκλίνουσες ενέργειες και με κοινή δράση και ενώ βρισκόσασταν σε ήρεμη ψυχική κατάσταση, σκοτώσατε άλλον».
Παράλληλα, ο ανακριτής περιγράφει τον τρόπο με τον οποίο έγινε η δολοφονία, σύμφωνα με τα στοιχεία που εξετάστηκαν:
«…προσεγγίσατε τον Ιωσήφ Βαλυράκη, ο οποίος κινούνταν με το φουσκωτό σκάφος του ‘ΜΙΝΑ’ κι αφού παρεμποδίσατε την πορεία ενεργώντας επικίνδυνους ελιγμούς με το αλιευτικό σας γύρωθεν του φουσκωτού του σκάφους, διαπληκτιστήκατε μαζί του και στη συνέχεια με τη χρήση ενός ξύλινου μακριού κονταριού τον πλήξατε στο πάνω μέρος του κορμιού του τουλάχιστον 2-3 φορές, με αποτέλεσμα αυτός να πέσει χωρίς τη θέλησή του στη θάλασσα. Τότε κι ενώ το αλιευτικό σας σκάφος βρισκόταν καθόλη τη διάρκεια του διαπληκτισμού σε κίνηση, το απομακρύνατε από το σημείο εκείνο με κατεύθυνση προς το Πεζονήσι κι από την κίνηση αυτή του αλιευτικού, εν γνώσει σας, ο Ιωσήφ Βαλυράκης, ο οποίος βρισκόταν στη θάλασσα, ήλθε σε επαφή με την προπέλα και τα υδροπτερύγια του αλιευτικού σκάφους που βρίσκονταν στην πρύμνη του, καθώς και με αμβλείες επιφάνειες αυτού, με αποτέλεσμα να προκληθούν, εκτός από θλαστικά τραύματα στην κεφαλή, στον αριστερό αγκώνα και στον αριστερό δείκτη, αφενός αφετέρου εκχυμώσεις στην κεφαλή, στην αυχενική χώρα στον δεξιό βραχίονα και στο δεξιό αντιβράχιο».
Στη συνέχεια, ο ανακριτής περιγράφει όλες τις ενέργειες που έγιναν, όπως η εξέταση των καταθέσεων μαρτύρων, η άρση τηλεφωνικών απορρήτων, το φωτογραφικό και βιντεοληπτικό υλικό, καθώς και οι τεχνικές εκθέσεις πραγματογνωμόνων και ιατροδικαστών, ενώ επικαλείται και τις απολογίες των ψαράδων, από τις οποίες, όπως σημειώνει, «προκύπτουν σοβαρές ενδείξεις ενοχής» των κατηγορουμένων ως προς «την τέλεση της αποδιδόμενης πράξης».
Επιπλέον, ο ανακριτής παραθέτει τις καταθέσεις των δύο αυτοπτών μαρτύρων, οι οποίοι ισχυρίστηκαν ότι τα δύο αδέλφια διαπληκτίστηκαν με τον Σήφη Βαλυράκη και ήταν στο σημείο του θανάτου του με το αλιευτικό τους σκάφος.
Στο σκεπτικό της απόφασής του για προφυλάκιση, ο ανακριτής αναφέρει ότι «από τα ιδιαίτερα χαρακτηριστικά της πράξης του κατηγορουμένου, η οποία απειλείται στο νόμο με ποινή ισοβίου καθείρξεως ή πρόσκαιρης κάθειρξης τουλάχιστον 10 ετών, ήτοι της επίθεσης εν πλω για ασήμαντη αφορμή, χωρίς μάλιστα πρόκληση από τον παθόντα, της έλλειψης σεβασμού προς την ηλικία του, της αριθμητικής υπεροχής των δραστών σε βάρος του παθόντα, αλλά και της πρόκλησης θανάτου με άκρως οδυνηρό τρόπο, προκύπτει ότι ο εν λόγω κατηγορούμενος, εάν αφεθεί ελεύθερος είναι πιθανό να διαπράξει και άλλα παρόμοια εγκλήματα. Εξάλλου ενόψει των προαναφερθέντων ιδιαίτερων χαρακτηριστικών της πράξης του κατηγορουμένου, κρίνεται ότι η επιβολή περιοριστικών όρων δεν μπορεί να εξασφαλίσει ότι αυτός δεν θα διαπράξει άλλα εγκλήματα, ούτε ότι θα παραστεί οποτεδήποτε στην ανάκριση και αυτοπροσώπως στο δικαστήριο, έτσι ώστε να υποβληθεί στην εκτέλεση της απόφασης».